老师，只有FPKM的话，能用什么R包做差异分析啊？

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2019-12-12 09:32

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

如果是高通量测序的数据得到的FPKM表达量是不可以直接输入到R包里面做差异分析的，因为分析高通量数据差异基因的R包如edgeR ,DESeq2等都要求输入基因的count值。