关于转录组建库的问题。一是一个样品就是一个文库么?样品建库混合后如何能区分每个样品?二是文库如何被索引?

看到一篇文献上说“文库被索引,若干个文库被归一化然后合并起来,在单个流动小室上运行。总共多达100个文库运行在一个16道(lane)的流动小室上,是通常的做法。”

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

建库时每一个样品是分开建的,一个样品一个文库;由于机器一条lane测的数据量很大,而单个样品的数据量较少,就要将多样样品的文库混合起来一起测,从而充分利用测序通量;

在混和之前,也就是建库的时候,都会在每个样品文库上加上不同的index,用以区分样品,最后测序完成后,通过脚本将一条lane上的所有数据根据index信息再拆分成不同的样品。

详细的建库测序说明见视频课程《illumina建库测序原理及fastq讲解

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