WGCNA分析需不需要进行log转换?

我看了很多文献,都将FPKM值进行log转换,但是有一些人却不建议转换,他们认为这会降低的变异度。这个到底如何选择?

请先 登录 后评论

1 个回答

鹅子

本人尝试过进行转换计算,但是对结果的影响并不大,整个模块之间并没有发生明显变化,故可以直接基于fpkm进行,另官方说法是标准化之后的表达量做为输入,FPKM已经是进行标准化的结果,理论上不需要做转换。

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,4942 浏览
  • kuku93 提出于 2018-08-31 21:14

相似问题