15 GATK中call SNP出来的SNP里面的ALT列出现 * 星号啥意思?

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

这是由于 这个SNP附近有indel缺失造成的,大家可以参考GATK官方解释:https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360035531912?id=11029   以及vcf文件说明:http://samtools.github.io/hts-specs/VCFv4.3.pdf


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