WGCNA分析中，取材是，有5个植物发育时间点，两个品质高低不同的材料，三次生物学重复，也就是三十个样本，请问，针对其中某个材料某个时间点中的一次生物学重复不好的剔除后，影响WGCNA的分析吗？还有就是时间点可以作为一种表型作为输入文件吗？ - 组学大讲堂问答社区

5 WGCNA分析中，取材是，有5个植物发育时间点，两个品质高低不同的材料，三次生物学重复，也就是三十个样本，请问，针对其中某个材料某个时间点中的一次生物学重复不好的剔除后，影响WGCNA的分析吗？还有就是时间点可以作为一种表型作为输入文件吗？

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分类：WGCNA

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1 个回答

microRNA 2018-09-12 18:40

1. 生物学重复不太好的话，可以将该样本剔除。其实WGCNA的分析过程中也有异常样本的检测和剔除

2. 时间点可以做为表型。这样可以关联与时期相关的基因模块。

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邹先炎提出于 2018-09-12 16:45