老师您好,我在做物种间基因组共线性分析时没有得到.anchors文件并且出现list index out of range报错,请问一下是什么原因?

attachments-2020-05-jMq0eAbF5ed23d24edc08.jpgattachments-2020-05-kR2yg1PV5ed23d2d1e2dc.jpgattachments-2020-05-YfrxSjrO5ed23d3a4ad40.jpg所选的基因组是线粒体基因组测序的结果。

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

文件格式有问题吧,你的bed文件才14行,有问题吧

如果基因这么少,没必要用mcscan比较基因组分析了;做个blast就好了

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空谷临风

我也遇见过,发现染色体按顺序排列后(bed里)就可以运行了

可以试下

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