老师您好，我在做宏基因组学分析时，由于样本数据量过大，将所有样本质控后的reads用进行组装时，会出现服务器内存不足无法组装的情况。那我想将每个样本的数据分别组装，然后将样本contig文件进行合并后再进行下游分析。这种方法可行吗？ - 组学大讲堂问答社区

5 老师您好，我在做宏基因组学分析时，由于样本数据量过大，将所有样本质控后的reads用进行组装时，会出现服务器内存不足无法组装的情况。那我想将每个样本的数据分别组装，然后将样本contig文件进行合并后再进行下游分析。这种方法可行吗？

回答问题即可获得 10 经验值，回答被采纳后即可获得 10 金币。

0 条评论
分类：宏基因组

默认排序时间排序

1 个回答

omicsgene - 生物信息 2020-06-01 11:32

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

不可行，分别组装，里面会有重复的；

1 关注
0 收藏，2702 浏览
姜淞提出于 2020-05-30 21:39