10 请问老师做无参转录组分析某一家族基因可以把其核苷酸序列翻译为蛋白序列后比对吗？
之前在某一物种中做了无参转录组。
想分析该物种中某一家族基因，并用其与其他基因组清晰物种的同家族基因进行进化分析，可以把核苷酸序列翻译为蛋白序列后比对吗？需要注意什么？
虽然无参转录组可能得到的在该物种中的该家族基因不是很全面，但是我大致浏览了一下，还是有一定的有用信息，所以考虑做这方面的分析。老师评价一下？谢谢！
最佳答案 2020-06-09 09:44
无参会有三个序列文件，一个是unigene的序列、cds的序列、pep的序列。
如果没的话，你可以翻译一下。
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老师好！请问问题中这种情况可以用unigene序列和其他物种的某一基因家族去进行blast，进而做一些保守基序分析和进化树分析吗？
可以这么操作。