我下载的unmasked基因组和对应的GFF，GFF文件比基因组大的多，而且用TBtools提取的基因组序列，结果生成一个FA文件和一个FAI文件，提取的序列文件是空的。我想请教一下，这种情况应该怎么解决？

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3 个回答

omicsgene - 生物信息 2020-06-12 18:07

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的文件下载的有问题吧，确定是标准的GFF文件；

ＴＢｔｏｏｌｓ没用过提取序列文件，不太清楚；

Randongdong 2020-06-12 18:29

我需要数据的物种，在NCBI上没有找到对应的GFF文件，在一篇论文里通过CoGo网址找到的，不知道可靠性有多大？

Randongdong 2020-06-12 18:29

我需要数据的物种，在NCBI上没有找到对应的GFF文件，在一篇论文里通过CoGo网址找到的，不知道可靠性有多大？