20 今天python版本的MCscanX在用于比较基因组学分析时突然出了问题
更新一下细节：
问题应该出在lastdb这一步。是不是blast出了问题？关键是我一个月之前还能用的，中间重装了一次linux系统（还是用的组学大讲堂的装机包），但是这次用就不行了。
生成的last文件为空，关键是原来可以跑成功的cds文件和bed文件这次也不行了，汗...
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（以下原回答）
原来是用都好好的；
但是今天用的时候用原来一样的.cds和.bed文件却一个anchor都找不到了；和原来一样的操作步骤也不行。。。
不知道为什么？
这是命令行：/biosoft/miniconda/miniconda2/bin/python -m jcvi.compara.catalog ortholog Oryza_sativa Zea_mays --cscore=0.7
这是报错：
以下是输入文件：
.bed:
Os:
Zm:
.cds
Os:
Zm:
最佳答案 2020-06-23 19:17
问题已解决；
根据组学大讲堂提供的MCscanX的安装方法（https://www.omicsclass.com/article/284）；重新下载了lastdb加入到环境变量中。
