5 想请教一下，stringtie定量后，得到一个基因对应多个转录本，那么它的定量结果，即FPKM值应该如何取舍？

NC_006583.3transcript251990322081.-.gene_id "gene0"; transcript_id "rna0"; ref_gene_name "ENPP1"; cov "0.0"; FPKM "0.000000"; TPM "0.000000";
NC_006583.3transcript2519903220811000-.

gene_id "gene0"; transcript_id "rna1"; ref_gene_name "ENPP1"; cov "3.143961"; FPKM "0.873265"; TPM "1.713859";

您好，我的大部分基因都是一对多的情况，具体该怎么解决，谢谢！
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1 个回答

microRNA

你这个是GTF文件中的结果吧？ 你这个不行，需要采用其他的定量软件进行定量，如HTSeq-count。

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