如何将基因组序列里的简并碱基变成N或者保留其中一种? 脚本是啥？ - 组学大讲堂问答社区

如何将基因组序列里的简并碱基变成N或者保留其中一种? 脚本是啥？

在进行批量indel标记设计的时候，出现如下错误，[ERRO] illegal DNA/RNA/Protein sequence: 248, you may switch on -d/--degenerate or -r/--use-regexp

原因好像是因为基因组序列里有简并碱基，所以怎么处理，使能够正常设计引物

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omicsgene - 生物信息 2020-07-12 20:36

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

我们重测序课程里面有indel批量设计，里面有脚本可以很快完成，建议学习一下：

重测序数据自主分析：

https://bdtcd.xetslk.com/s/1VQOjQ