发现
问答
发起
提问
文章
文章
更多
专家
讲堂
话题
财富榜
商城
Toggle navigation
首页
(current)
问答
文章
视频课程
话题
商城
搜索
登录
注册
TCGA的转录组数据如何进行差异分析?
TCGA
差异表达
从TCGA上下载了转录组的数据,请问如何进行差异表达分析?
0 条评论
分类:
TCGA
请先
登录
后评论
默认排序
时间排序
1 个回答
microRNA
2018-07-04 11:25
一般做差异分析的话,建议采用基因的Counts值, 可以采用的软件主要有DESeq2 ,edgeR等。
请先
登录
后评论
您需要登录后才可以回答问题,
登录
或者
注册
关注
1
关注
收藏
0
收藏,
5012
浏览
zhangqx
提出于 2018-07-03 10:37
相似问题
请教一下TCGA的蛋白数据怎么理解,它是有正负值的,这个正负值代表什么意思,为什么蛋白表达会有负值?我只想给它分成高表达,低表达和表达缺失组应该怎么处理呀?
0 回答
TCGA下载 docker报错
0 回答
TCGA差异分析如何根据临床信息分组?
1 回答
TCGA用R数据下载错误
1 回答
老师,想请教一下TCGA基因表达数据的问题,我从xena.ucsc网页上下载了基因表达数据TCGA-CESC.htseq_counts.tsv;然后发现该数据中只有Ensembl格式的基因ID ,没有SYMBOL格式的。所以接下来进行基因ID格式转换,却发现同一个SYMBOL ID对应的多个Ensembl格式的ID,想问下老师,这种情况该怎么处理?同一个SYMBOL ID所对应的多个Ensembl格式ID的基因表达数据应该留下哪一个?
1 回答
TCGA的RNA-seq count annotation过滤,有些不知道是否需要删除
0 回答
×
发送私信
发给:
内容:
×
举报此文章
垃圾广告信息:
广告、推广、测试等内容
违规内容:
色情、暴力、血腥、敏感信息等内容
不友善内容:
人身攻击、挑衅辱骂、恶意行为
其他原因:
请补充说明
举报原因: