GO和KEGG富集分析keytype选择？

您好，请问一下我现在要分析的拟南芥，org.At.tair.db及分析所需的包已经安装，我的DEG_list里的ID是AT3G24240（应该是ensembl ID）,keytype应该填什么啊？谢谢！

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2 个回答

omicsgene - 生物信息 2020-09-15 10:01

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

ID类型keytype 填写 ensembl 就好了；

转录组课程里面有相关课程：https://bdtcd.xetslk.com/s/29EigM

荣 2020-09-16 00:41

GO富集分析出来了，是DEG_list.txt文件格式不对，但是我想要后面gene ID是DEG_list.txt里的ID啊，该这么处理啊？