问一下老师们，提取成对基因的时候得到结果文件总是为空是什么原因，下面是我的输入文件perl ../script/KAKS_SHAIXUAN.pl -in1 WRKY_cds_confirmed.fa.fai -in2 WRKY_cds_confirmed_blast.out -out duplication_gene.out就是这条命令。 - 组学大讲堂问答社区

问一下老师们，提取成对基因的时候得到结果文件总是为空是什么原因，下面是我的输入文件perl ../script/KAKS_SHAIXUAN.pl -in1 WRKY_cds_confirmed.fa.fai -in2 WRKY_cds_confirmed_blast.out -out duplication_gene.out就是这条命令。

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分类：基因家族分析

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2020-10-12 14:04

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

输入文件没错，可能就是没有筛选到相应条件的重复基因；

你可以尝试降低筛选条件重新筛选试试；

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空欢喜提出于 2020-10-12 13:53