16S多样性分析docker镜像发布及使用中，合并fasta文件，并加序列号部分的命令中，rename_fa_id.pl显示没有此命令，请问老师是怎么回事？

qiime1分析pick otu 聚类，16S多样性分析docker镜像发布及使用中，合并fasta文件，并加序列号部分的命令中，rename_fa_id.pl显示没有此命令，请问老师是怎么回事？

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分类：宏基因组

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肥尔普嵩 2020-10-17 22:42

#合并fasta文件，并加序列号
for i in `cat $fastmap |grep -v '#'|cut -f 1`; do 
    rename_fa_id.pl  -f $workdir/4.remove_chimeras/$i.ref.nonchimeras.fa \
        -n $i -out $i.fa
done

omicsgene - 生物信息 2020-10-18 12:56

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

镜像使用方法及代码：https://bdtcd.xetslk.com/s/qZRiF

16S多样性分析docker镜像发布及使用中，合并fasta文件，并加序列号部分的命令中，rename_fa_id.pl显示没有此命令，请问老师是怎么回事？

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