gff文件包含gene,cds,exon,mRNA的信息，但gene 和mRNA名称相同，不利于建立基因组索引，如何使用AWK命令批量只在mRNA的ID后面＋.1？

例如：修改前

01EVMgene590510967.+.ID=GB_A01G0001;

A01EVMmRNA590510967.+.ID=GB_A01G0001;Parent=GB_A01G0001;

A01EVMCDS59056099.+0Parent=GB_A01G0001;

修改后：

01EVMgene590510967.+.ID=GB_A01G0001;

A01EVMmRNA590510967.+.ID=GB_A01G0001.1;Parent=GB_A01G0001;

A01EVMCDS59056099.+0Parent=GB_A01G0001;

默认排序时间排序

1 个回答

omicsgene - 生物信息 2020-11-21 09:15

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

建议学习学习 linux系统的使用，里面有基础命令AWK的讲解：https://bdtcd.xetslk.com/s/17gwqZ