测序数据质控中Q20、Q30是什么意思?包括合同中写的Q30大于80%。

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红橙子

高通量测序中每测一个碱基都会给出一个对应的质量值,这个质量值是衡量测序准确度的,20的错误率为1%,30的错误率为0.1%。行业中Q20与Q30则表示质量值≧20或30的碱基所占百分比,如转录组中测了10G的数据量,其中有9G的碱基质量值大于或等于20,那么Q20则为90%,同理有9G的碱基质量值大于或等于30,那么Q30则为90%.

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  • 红橙子 提出于 2020-12-18 12:32

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