处理样本一般标红色荧光cy5 （R） ，对照样本标绿色荧光cy3 （G），
两个比值 你自己看想用哪个用那个，这些样本信息文字要看看：
log2（R/G） 这个比值就是差异比较结果
5 安捷伦双色通道：探针表达值是什么？log2（R/G）还是 log2（G/R）
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R是红色的处理组的荧光，G是绿色的对照组的荧光。这里的“对照组”是指健康人的标本吗？R/G的意义是什么，log2（R/G）就是探针表达量吗？下图有两个channel 因此是双色通道，经过log2转换过。然而下面出现了log2（G/R），完全使数据的正负性发生了改变，进而影响了我对logFC的判断，不知道该探针到底是上调还是下调了。
什么意思啊？log2（R/G）就是探针表达量吗？想用哪个用哪个，不是会影响对所以基因上下调的判断吗
因为标准化处理后得到的文件，下一步就是 进行 差异表达分析了。火山图之类的。
老师 俺和您的认知水平有限，有些问题可能您默认我知道，但是俺真的就是这么简单的也不知道，您能否跟我说得清楚点呢