做WGCNA分析时,课件给的trait_D.txt文件是自己做的还是都可以用,我现在有LncRNA和mRNA差异表达的数据,想用WGCNA做它们的共表达,应该如何操作?

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1 个回答

Daitoue

1、演示过程的数据是匹配的数据,其表达数据和性状实际是基于同一个实验统计和整理的,所以分析过程是基于实际分析的表达数据整理得到的,针对具体的实验数据,性状不一样的,需要你基于自己的数据去整理,或者基于实验去测量。(并不是我的数据可以用在你的分析---而是你的数据用于你的分析)

2、lncRNA和mRNA差异表达的数据?差异表达?WGCNA用的是表达数据,不是差异表达,你需要拿到二者一起标准化后的表达数据。

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  • 姚燕 提出于 2018-10-10 12:47

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