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老师们好,我想用kaks分析蛋白编码区,然后呢师兄告诉我,让我用mafft对蛋白编码区进行比对,然后用phyloSuite转换序列格式,最后我把每个cds都放到了一个里面,进行计算,但是总是报错,说序列不相等,不知道怎么解决,求问各位大佬,有没有相关视频,可以告诉我这个小白怎么在linux系统里运行kaks吖,万分感谢
KaKs_Calculator
0 条评论
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linux
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omicsgene
- 生物信息
2021-03-22 11:40
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS
这个课程里面有详细的kaks计算方法:
https://bdtcd.xetslk.com/s/1BAqPp
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江江江
提出于 2021-03-21 15:02
相似问题
老师们好,我想使用KaKs_Calculator计算knks,现在有同源基因的配对文件以及两个物种的非编码序列文件,该怎么根据同源基因列表提取对应的序列并且比对,然后得到.axt格式的输入文件?谢谢!!!
0 回答
ka k s 分析过程中遇到两个序列不相等,结果文件为空,安装老师那篇回答里面检查并修改,运行命令后出现下面的结果,命令被杀死了killed
1 回答
请问Divergence-Time是 T = K s /2 r 计算吗?
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计算复制基因kaks not equal
1 回答
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