老师好，如何去除指定区间的序列啊

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我百度了很多可以提取指定区间序列的方法比如samtools就很简单：samtools faidx input.fa chr1:100-200 > chr1.fa

但是我没有找到反选的，就是除了指定区间我都不要

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2021-06-18 22:02

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

那你自己反选一下就好了；

samtools faidx input.fa chr1:200-100000000 > chr1.fa
samtools faidx input.fa chr1:0-100 > chr11.fa