如何判断一个基因是否是差异基因?如果是差异基因,如何判断该基因的表达量是上调还是下调?


请先 登录 后评论

最佳答案 2018-06-28 13:44

首先对readcount进行标准化处理;然后根据模型进行假设检验概率(pvalue)的计算;最后进行多重假设检验校正,得到FDR值(错误发现率) ,差异基因的筛选阈值为FDR<0.01,|log2FoldChange|>=1

对于差异基因,如果基因的log2Foldchange>0,则认为该差异基因是上调,反之,若log2Foldchange<0,认为该差异基因是下调。


请先 登录 后评论

其它 0 个回答

  • 1 关注
  • 0 收藏,13015 浏览
  • landy 提出于 2018-06-27 18:25

相似问题