进行有参比对时,输入文件不为空,但是比对后的sam文件为空,这是啥原因。另外测序为单端测序,是否链式未知(公共数据库)。
hisat单端数据用 -U 而不是 -1 你修改下:http://daehwankimlab.github.io/hisat2/manual/
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结果一样呀