微生物多样性分析课程:运行r脚本出错 ,提示there is no package called ‘getopt’

运行r脚本:species_accumulation_curve.r  -i $workdir/4.export_data/feature_table_tax_rare.txt       -n species_accumulation_curve  

出错,提示:

Error in library(getopt) : there is no package called ‘getopt’

Execution halted

请问老师,这个r脚本是需要调用getopt这个包?服务器里是安装有这个包的,该如何解决?谢谢!

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

请用指定版本的镜像:omicsclass/ampliseq-q1:v1.2

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,2467 浏览
  • cashing 提出于 2021-09-21 23:24

相似问题