回交是避免搭便车效应,避免假阳性。你不能保证你这个突变株 与野生型只有关注的位点不一样,其他地方完全一样。
在M7代1000个品系中,筛选获得30个茎色为紫色的突变体,难道不可以不经过回交,直接将这30个品系分别提取DNA,然后再等量混合进行二代全基因组重测序,从而扣 snp,以定位到基因么? 你这个方法就不是mutmap了是qtl-seq
为什么必须要有回交过程?比如:EMS诱变野生型3000份材料,共获得1000份表型(比如地上部分的籽粒性状、花色性状等)突变体。后续对茎色进行突变表型筛选,在M7代1000个品系中,筛选获得30个茎色为紫色的突变体,难道不可以不经过回交,直接将这30个品系分别提取DNA,然后再等量混合进行二代全基因组重测序,从而扣 snp,以定位到基因么? 此方法和将这30个稳定突变体材料分别与也野生型杂交获得F1代,F1代自交获得茎色分离3:1,分别构建野生型混池和突变型混池,进行二代全基因组重测序,从而扣 snp,以定位基因。以上这两种方法有什么区别?