老师您好,我这边在处理扩增子数据分析时,进行OTU分析时不论用哪种方法都会报错“ERROR RAISED DURING STEP:Assign taxonomy” segmentation fault,用您那边提供的样本数据也是有这个报错,请问怎么解决呀!

2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

可以看看这个问题: https://www.omicsclass.com/question/3975 

怀疑是内存不够,你找个内存高的电脑试试的,至少20G以上的吧;

 

或者把这两个文件的内容贴一下我看看:attachments-2022-01-h29DStfa61dd430d56689.png


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文刚
老师您好,我刚刚去看了您说的那两个文件,那是两个txt格式的空文档,里面没有任何内容,内存的话我等下换台电脑试试,您先看看是不是这两个文档的问题。

你好,请问你解决了吗,我也一直是Segmentation fault

你好,请问你最后问题解决了吗,我也是“ERROR RAISED DURING STEP:Assign taxonomy”报错,但是后面显示的是Stderr sh: line 1: 1085 Killed 还有burrito.util.ApplicationError: Unacceptable application exit status: 137,我也不知道怎么解决,比对选用的也不是rdb

电脑内存不够杀死了

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