老师,我用hmmsearch 没搜索出结果,然后用拟南芥的query.fa和我要分析的物种cds进行blast分析,比对出来的基因只有几个,我老师说我要做的基因有200多个,完全对不上,不知道该怎么办了,请教下老师。

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

不同的家族 , 家族成员的数量是不一样的,我不知道你研究的是哪个家族;

建议你查阅文献,详细了解这个家族的特点,看看别人在别的物种里面如何鉴定的;

家族成员的数量可以参考近缘物种该家族的数量,

相信你详细了解自己的家族成员的特点之后自己就可以判断了;

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