bedtools intersect -wo -nonamecheck -F 0.1 -a region_merged.bed -b $vcf >var.txt

bedtools  intersect -wo -nonamecheck -F 0.1  -a  region_merged.bed -b $vcf >var.txt

***** ERROR: -b option given, but no database file specified. *****

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

$vcf 这个变量没有设置,你设置一下,或者指定vcf文件的路径:


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  • 猫爪草 提出于 2022-02-17 10:05

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