黄老师，从转录因子数据库（http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/）下载的某物种某家族的序列与用HMM模型搜索出来的序列有什么不同？哪个更准确？ - 组学大讲堂问答社区

黄老师，从转录因子数据库（http://planttfdb.cbi.pku.edu.cn/）下载的某物种某家族的序列与用HMM模型搜索出来的序列有什么不同？哪个更准确？

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分类：基因家族分析

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2018-10-30 17:03

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

分析方法不同搜索出来的基因会有差异，这是正常的，不好评价准确性，这个需要比较才能知道。我只能说你可以详细看看各自是通过什么方法鉴定的。可以手动到NCBI的CDD，SMART等数据库再确认一下他们的准确性。