OUT分析速度太慢

老师您好!我每次进行下图中OUT分析时,速度特别慢,我改用了blast分析(可能是速度慢的原因之一),同时我的qiime.fasta数据差不多是在300M(和老师教案中大小差不多),但是我速度太慢了,跑了将近一整天都跑不出来,也不报错,电脑配置也不差,请问如何提高速度,另外两种pick_open_reference_otuspick_closed_reference_otus方法也试了,很慢。attachments-2022-06-PkV0jQDi62bbcb581b284.png

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

跑一天正常的,想速度快只能提高电脑配置;

数据量再多可能会跑好几天

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啦啦啦种太阳

好的,谢谢您百忙之中为我答疑

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  • 啦啦啦种太阳 提出于 2022-06-29 11:48