老师您好,我想用GWAS对候选基因进行进化选择分析,我想证明我的这个基因是受到人工驯化的。我用TajimaD分析发现我的目的基因位置的D值为5,属于受到瓶颈效应或者平衡选择,那么这个结果可以说明我的基因是受到驯化选择的吗?

老师您好,我想用GWAS对候选基因进行进化选择分析,我想证明我的这个基因是受到人工驯化的。我用TajimaD分析发现我的目的基因位置的D值为5,属于受到瓶颈效应或者平衡选择,那么这个结果可以说明我的基因是受到驯化选择的吗?

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2 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你可以用野生种做个对比,一般野生种在这个基因附近多样性高,驯化品种多样性低;

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王辉

我的这个基因很有意思,野生种的pi低,栽培种的pi高,而且野生种和栽培种的fst值差异非常明显。tajimaD的D值为5,这个结果能否说明我这个基因为受到驯化的基因呢?

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  • 王辉 提出于 2022-08-18 12:17