Use of uninitialized value $l in numeric lt (

Use of uninitialized value $l in numeric lt (<) at vcfutils.pl line 566.

bcftools mpileup -Ou -f 02428.genome.fa I662_sorted_dedup_reads_realigned.bam.recal.bam| bcftools call -c| vcfutils.pl vcf2fq -d 10 -D 100 | gzip > 3dilpoid.fq.gz

做PSMC的准备文件vcfutils.pl vcf2fq总是报错Use of uninitialized value $l in numeric lt (<) at vcfutils.pl line 566.

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分类：遗传进化

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2022-11-19 08:19

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

bcftools mpileup 少了个参数 -I 吧

Use of uninitialized value $l in numeric lt (<) at vcfutils.pl line 566.

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