基因组survey时K值的选择 - 组学大讲堂问答社区

10 基因组survey时K值的选择

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请问我不知道我测序的物种基因组多大，利用二代数据进行survey时，K值设置17，19，21时基因组大小、杂合度差异都很大，这种情况我应该选择K值为多大呢？

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分类：基因组学

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2022-12-16 17:11

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

K值对基因组大小的评估影响不大，你这个基因组不知道多大，可能测序量不够吧；

建议做流式细胞评估一下基因组大小，加测数据

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Mr.Black 提出于 2022-12-11 21:37