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老师好,我购买了咱们的群体研究,请问如何计算vcf文件中某段范围内的纯合基因型(GT)频率?
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重测序
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2023-07-20 09:47
我目前的计算思路是,提取这个范围内的SNP位点,然后对范围内的0/0 和1/1的出现次数进行计数求和,之后除所有基因型出现的次数,不知道这么计算对不对,还有一个问题就是计算是否要算上缺失的位点
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Iron
采纳率 14% | 回答于 2023-07-15 17:49
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Iron
提出于 2023-07-15 17:46
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