15 老师好，我购买了咱们的群体研究，请问如何计算vcf文件中某段范围内的纯合基因型（GT）频率？

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最佳答案 2023-07-20 09:47

我目前的计算思路是，提取这个范围内的SNP位点，然后对范围内的0/0 和1/1的出现次数进行计数求和，之后除所有基因型出现的次数，不知道这么计算对不对，还有一个问题就是计算是否要算上缺失的位点

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  • Iron 提出于 2023-07-15 17:46

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