老师好，我在跟着课程实操时，运行gatk call snp时候，使用源代码也报错了，我用的镜像是课程里的v1.1的版本还请老师帮忙看看，谢谢了！ - 组学大讲堂问答社区

5 老师好，我在跟着课程实操时，运行gatk call snp时候，使用源代码也报错了，我用的镜像是课程里的v1.1的版本还请老师帮忙看看，谢谢了！

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分类：重测序

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1 个回答

omicsgene - 生物信息 2023-09-17 10:18

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

你的命令行写错了，看不到你的命令行，你自己检查检查的；

脚本前面有些变量需要设置，你记得运行设置；

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宇宙菠萝包提出于 2023-09-16 10:59