老师,求助,转录组差异表达基因分析报错-只有pfd文件没有PNG文件,且PDF打不开

[root@9dfb61184b6e  08:23:54 /work/my_rnaseq/5.deg]# Rscript $scriptdir/heatmap.r -i $workdir/4.expression/all_gene_fpkm.tsv -l S10_vs_J10.DEG.final.tsv -p S10_vs_J10.deg_gene_heatmap -o ./

--> Q&A for bioinformatics, please visit the website: https://www.omicsclass.com/

--> R beginners ? I suggest your  learning  R language: https://study.omicsclass.com/index

Error in hclust(d, method = method) :

  NA/NaN/Inf in foreign function call (arg 10)

Calls: pheatmap -> cluster_mat -> hclust

Execution halted

只有-rw-r--r--. 1 root root  3.6K Nov  6 08:25 S10_vs_J10.deg_gene_heatmap.pdf

没有pngpdf打不开



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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

绘图失败了,你这个 输入文件都检查一下看看的,文件之间的ID是否一致

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  • 静默如初 提出于 2023-11-06 08:37

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