samtools faidx: different length in sequence

您好! 您在2020年8月用samtools获取染色体长度时有一个different line length in sequence contig1的报错，这个问题解决了嘛？ 我最近也遇到了相同的问题

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1 个回答

天使不设防

samtools faidx 构建索引前提是每行序列长度一致，单条fasta序列最后一行可以比其他行短。你这个错误应该是contig1这条序列某行长度不一致引起的  

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  • Wenxin Wu 提出于 2023-11-16 19:13

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