已经解决了。
用NotePad++打开ALN 文件后要复制所有的内容
5 如何用BoxShade正确呈现miRNA 多序列比对的结果
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老师您好，我用ClustX对121条miRNA序列进行了多序列比对，并将比对的ALN文件粘贴到Boxshade中，但是输出的结果，基因名称不是我原本的名称，且序列比对结果也比较乱，不知道为什么？
我输入的ALN文件格式如下：
ath-miR156g ---CGACAGAAGAGAGUGAGCAC---
mdm-miR156e ----GACAGAAGAGAGUGAGCAC---
cca-miR156k ----GACAGAAGAGAGUGAGCAC---
ath-miR156a-5p ---UGACAGAAGAGAGUGAGCAC---
ath-miR156b-5p ---UGACAGAAGAGAGUGAGCAC---
ath-miR156c-5p ---UGACAGAAGAGAGUGAGCAC---
ath-miR156d-5p ---UGACAGAAGAGAGUGAGCAC---
ath-miR156e ---UGACAGAAGAGAGUGAGCAC---
ath-miR156f-5p ---UGACAGAAGAGAGUGAGCAC---
但是BoxShade 结果如下：
不知道哪里出的问题 请老师帮我解答一下，万分感谢！