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GWAS课程中LD分析使用示例数据一直做不出来,检查很久都没有解决问题,麻烦老师进行解答。
GWAS
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遗传进化
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Chen jie yang xi rêve
2023-12-01 16:10
已解决,需要在04.LDdecay中建立一个popid.txt文本文件,里面包含所有样品名称
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Chen jie yang xi rêve
提出于 2023-12-01 14:09
相似问题
老师您好,针对这个问题https://www.omicsclass.com/question/7725。你们提到:你这个数据里面是不是P值有0的情况,取了对数就无穷大了,导致出问题。但是,我发现里面没有P值为0的情况,那是不是脚本gwas_manhattan_plot.r有问题呢?需要修改gwas_manhattan_plot.r脚本的什么地方才可以解决顶部只能画半圆的问题呢?还有,我发现P-Value的原始文件有NaN的情况,是什么原因呢?是否对GWAS有影响呢?
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