基因家族数据准备运行错误

基因家族数据准备过程中,运行保留蛋白质编码基因命令“agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff  $gff --attribute biotype --value protein_coding -t '!' -o $species.protein_coding.gff3” 后运行出现错误,反复几次验证都是错误的,错误代码为gff3 reader error level1: No ID attribute found  ************** Too much WARNING message we skip the next **************

请先 登录 后评论

1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

GFF文件不标准,有错误导致脚本出错,

是NCBI上的GFF文件吗?如果是可能需要手动修改就错才行;

请先 登录 后评论
  • 1 关注
  • 0 收藏,647 浏览
  • 提出于 2023-12-01 21:57

相似问题