有参转录组分析,合并样本count值文件报错。

python $scriptdir/merge_gene_count.py -p all_gene_count -f normal_rep1_gene.tsv -l normal_rep1 -f normal_rep2_gene.tsv -l normal_rep2 -f normal_rep3_gene.tsv -l normal_rep3 -f tumor_rep1_gene.tsv -l tumor_rep1 -f tumor_rep2_gene.tsv -l tumor_rep2 -f tumor_rep3_gene.tsv -l tumor_rep3

Traceback (most recent call last):

  File "/mnt/data/home/tycloud/RNAseq/scripts/merge_gene_count.py", line 12, in <module>

    import pandas as pd

ModuleNotFoundError: No module named 'pandas'

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

请使用我们的镜像分析数据,里面安装了所有的软件;

你自己分析需要配置软件,你安装一下python的pandas这个包;

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  • shidandan 提出于 2023-12-04 22:22

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