老师，您好，请问：当我在用下载的参考基因组做注释库时，首先是保留蛋白编码基因，运行代码是：agat_sp_filter_feature_by_attribute_value.pl --gff $gff --attribute gene_biotype --value protein_coding -t '!' -o P1.protein_coding.gff。再查看结果文件的时候发现不对劲，比如原本的gff文件打开是从染色体NC_063982.1开始，当我打开生成的蛋白质编码文件时染色体是从NC_063996.1开始，是过滤掉很多染色体吗？。查看了输出的protein_coding_discarded.txt文件，这个文件里基本都是gene-biotype不是蛋白质编码的。
