多个hmm文件可以cat一起,一起输入hmmsearch搜索多个的。
但是,新手建议分开搜索再合并
老师好,请问想一次搜索多个pfam应该如何修改命令“hmmsearch --domtblout WRKY_round1_hmmerOut.txt --cut_tc WRKY.hmm ../01.data_prepare/Arabidopsis_thaliana.gene.pep.fasta”;
对于ring finger这种pfam众多的家族,可以一次性把所有pfam一起做出来吗?还是一次只能搜索一个然后手动把搜索出来的所有序列和ID合在一起?谢谢老师解答!