CNV分析

老师,您好,我在做CNV 分析的时候,所用参考基因组不是染色体水平,而是scaffold,那我在用perl $scriptdir/split_chr.pl -ref $REF -lenFilter 10000000 -od split_chr_dir,指令时,该怎么对应修改脚本文件呢

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

没到染色体不建议分析CNV,

修改一下这个:-lenFilter 可以改小一些,保留更多的scaffold

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  • 叶雪儿 提出于 2023-12-26 10:35

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