16s分析导入数据遇到同样的问题,请问您解决了吗?

There was a problem importing /work/omicsclass/ampliseq-q2/qiime2_2022.8/data_2/manifest.ckd.txt:


  /work/omicsclass/ampliseq-q2/qiime2_2022.8/data_2/manifest.ckd.txt is not a(n) PairedEndFastqManifestPhred33V2 file:


  Filepath on line 3 and column "forward-absolute-filepath" could not be found ($datadir/AWGB16SAA2134120-38-28_R1.fq.gz) for sample "AWGB16SAA2134132-38-28".

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1 个回答

omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

这个shell变量是不是没有 export设置正确,再看看视频吧:datadir

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  • gongqinglong 提出于 2024-03-01 18:18

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