使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448 - 组学大讲堂问答社区

使用tassel软件对vcf文件排序时出现ERROR net.maizegenetics.plugindef.AbstractPlugin - java.lang.IllegalArgumentException: AlleleDepthUtil: depthIntToByte: Can not have negative depth values: -8448

您好，我在使用tassel进行排序时报错，不知道为什么会有负深度

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分类：重测序

默认排序时间排序

1 个回答

omicsgene - 生物信息 2024-03-25 10:27

擅长：重测序,遗传进化,转录组,GWAS

那你需要检查vcf文件格式问题了；

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mike 提出于 2024-03-18 18:42