请问，老师，在做选择清除分析时，比如说基于核苷酸多样性降低的ROD方法，在脚本中窗口是100000，步长是100000.不同的研究对象是不是要更改窗口和步长大小，植物和昆虫的应该也不一样把？这个是根据遗传距离来改吗？
窗口和步长没有固定的，你可以根据基因组大小，平均连锁距离来合理设置；
基因组大可以适当加大窗口长度，L D连锁大也可以加大窗口；
也可以多试试几组数据，看看哪个效果好用哪个了；
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