hifiasm 主要用pacbio ccs的HiFI测序数据组装，你的ONT的数据错误率高 组装不出来；
为什么我hifiasm组装出来的文件基本都是空的呢？
source ./env.sh
cd $workdir
mkdir 10.assembly_hifiasm
cd 10.assembly_hifiasm
hifi=$datadir/dujuan_output.fastq
hifiasm -o hifi.asm -t 8 $datadir/dujuan_output.fastq
#get primary contigs in FASTA
awk '/^S/{print ">"$2; print $3}' hifi.asm.bp.p_ctg.gfa > hifi.asm.bp.p_ctg.fasta 这是运行代码
