MITE转座子

请问使用基因组注释课程的脚本,注释出的MITE类DNA转座子是否会和P, PIF, TcMar, hAT等类型的DNA转座子有重复?

MITE类转座子的结果非常高正常吗?我按照脚本运行,没有报错,结果如下,只有MITE和Gypsy的含量非常高,其他重复序列含量都很低

另外,最后这个统计表中比如DNA、LTR所在的行,对应的后面count, masked%的值应该怎么理解?

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2 个回答

Mr.Black

MITE是不是应该再进行分类?

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omicsgene - 生物信息
擅长:重测序,遗传进化,转录组,GWAS

视频课程里面有讲的你看看的;https://bdtcd.xetslk.com/s/2TnPfm

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  • Mr.Black 提出于 2024-05-06 15:20

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